Cuerpo Colegiado que ejerce la Dirección Superior, a través de la definición de la política administrativa, financiera, técnica y operativa; aprueba y modifica planes y programas de trabajo.
Asimismo, define las directrices de planes y proyectos para la conservación, mejoramiento y desarrollo de los puertos, atendiendo a la política nacional de Gobierno.
Está integrada por un Representante Titular y un Suplente de las siguientes entidades:
- Ministerio de Finanzas Públicas (Presidencia).
- Ministerio de Comunicaciones, Infraestructura y Vivienda.
- Empresa Portuaria Quetzal.
- Empresa Portuaria Nacional Santo Tomás de Castilla.
- Empresa Portuaria Nacional de Champerico.
- Ministerio de Economía.
- Ferrocarriles de Guatemala.
- Terminal Ferroviaria Puerto Barrios.
- Comité Coordinador de Asociaciones Agrícolas, Comerciales, Industriales y Financieras.
- Superintendencia de Administración Tributaria.